A公司是廈門的一家生物醫藥公司，2015年在廣州設立了一家分公司B公司。

這兩天，A公司的財務小林在年度企業所得稅申報過程中遇到了不少問題，帶著困惑的他特地到稅務局進行咨詢，如果您也是跨地區經營匯總納稅企業，在進行年度企業所得稅申報時也有不少困惑，那就快看看下面這些問答吧~

一、作為分公司的B公司需要匯算清繳嗎？

根據《國家稅務總局關于印發的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號），跨地區經營的二級分支機構需要匯算清繳，作為分公司的B公司需要年度申報，但如果總分機構AB公司都在廈門的，目前廈門的執行方式是：統一由總機構匯總納稅，分支機構不需要年度申報。

二、A公司和B公司如何計算各自的應納稅額？

根據《國家稅務總局關于印發的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號），由作為總公司的A公司匯總計算企業年度應納所得稅額，扣除總機構A和分支機構B已預繳的稅款，計算出應繳應退稅款，A公司繳納應納所得稅額的50%部分，剩余的50%由各分支機構分攤（本案例中只有一個分公司B，因此剩余的50%則由B公司全部承擔）。

三、作為分公司的B公司想享受研發加計扣除的稅收優惠，那應該找分公司的主管稅務機關廣州國稅備案，還是找總公司的主管稅務機關廈門國稅備案呢？

根據《國家稅務總局關于發布《企業所得稅優惠政策事項辦理辦法》的公告》(國家稅務總局公告2015年第76號)規定：“第十四條 跨地區(省、自治區、直轄市和計劃單列市)經營匯總納稅企業(以下簡稱匯總納稅企業)的優惠事項，按以下情況辦理：

①：如果分支機構享受所得減免、研發費用加計扣除、安置殘疾人員、促進就業、部分區域性稅收優惠(西部大開發、經濟特區、上海浦東新區、深圳前海、廣東橫琴、福建平潭)，以及購置環境保護、節能節水、安全生產等專用設備投資抵免稅額優惠，由二級分支機構向其主管稅務機關備案。其他優惠事項由總機構統一備案。

②：總機構應當匯總所屬二級分支機構已備案優惠事項，填寫《匯總納稅企業分支機構已備案優惠事項清單》，隨同企業所得稅年度納稅申報表一并報送其主管稅務機關。

因此，B公司的研發費用加計扣除的備案應該找分公司的主管稅務機關廣州國稅辦理。A公司應匯總B公司備案的優惠事項，填寫《匯總納稅企業分支機構已備案優惠事項清單》，隨同企業所得稅年度納稅申報表一并報送其主管稅務機關廈門國稅。

四、作為分公司的B公司2016年度因為臺風發生了資產損失，應如何申報？

根據《國家稅務總局關于印發的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號），第二十五條 匯總納稅企業發生的資產損失，應按以下規定申報扣除：

①：總機構及二級分支機構發生的資產損失，除應按專項申報和清單申報的有關規定各自向所在地主管稅務機關申報外，二級分支機構還應同時上報總機構;三級及以下分支機構發生的資產損失不需向所在地主管稅務機關申報，應并入二級分支機構，由二級分支機構統一申報。

②：總機構對各分支機構上報的資產損失，除稅務機關另有規定外，應以清單申報的形式向所在地主管稅務機關申報。

③：總機構將分支機構所屬資產捆綁打包轉讓所發生的資產損失，由總機構向所在地主管稅務機關專項申報。

臺風的資產損失屬于專項申報。分公司B應向廣州國稅做資產損失專項申報，同時向總公司A報告，總公司A應以清單申報的形式向廈門國稅申報。

五、A公司和B公司在辦理年度匯算清繳時，應報送哪些資料？

根據《國家稅務總局關于印發的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號）和 《國家稅務總局關于印發的通知》（國稅發〔2009〕79號）的要求：

匯總納稅企業匯算清繳時，總機構除報送企業所得稅年度納稅申報表和年度財務報表、備案事項相關資料外，還應報送總機構及分支機構基本情況、分支機構征稅方式、分支機構的預繳稅情況、匯總納稅企業分支機構所得稅分配表、分支機構的年度財務報表和分支機構參與企業年度納稅調整情況的說明。若總公司委托中介機構代理納稅申報的，還應出具雙方簽訂的代理合同，并附送中介機構出具的包括納稅調整的項目、原因、依據、計算過程、調整金額等內容的報告。若涉及關聯方業務往來的，同時報送《中華人民共和國企業年度關聯業務往來報告表》。

分支機構除報送企業所得稅年度納稅申報表(只填列部分項目)外，還應報送經總機構所在地主管稅務機關受理的匯總納稅企業分支機構所得稅分配表、分支機構的年度財務報表(或年度財務狀況和營業收支情況)和分支機構參與企業年度納稅調整情況的說明。

若發生資產損失、優惠備案等情況，還需依上述問題解答提供資料作為附送資料。

撰稿：海滄區國稅局