會計委派制實行分級委派、分級管理。省局負責地市及省局直屬單位的會計委派，地市局負責所轄縣局會計委派制的組織、管理和實施。在運作模式上，采取上級委派和集中報帳兩種方式。上級委派制：實行雙重管理，以業務主管部門為主，上級局負責考核任免，所駐人員同時向上級主管部門和所駐單位負責；集中報帳制：上級主管部門設立帳務管理中心，各核算單位帳務移交帳務管理中心，各核算單位設置報帳員，定期到帳務管理中心報帳，完全實現核算一體化。兩種方式均保證收支差額包干管理、財務收支計劃管理、所得稅清算及利潤分配等現有財務政策不變。