農業專業合作社自產自銷的小麥銷售給一般納稅人面粉加工銷售公司到稅務局代開增值稅專用發票，應按3%上稅。 根據《國家稅務總局關于免征增值稅農業增值專項附加扣除有關問題的公告》（稅務總局公告2017年第112號）規定：農業專業合作社自產自銷的小麥銷售給一般納稅人的，應按3%的增值稅稅率課征增值稅。 在農村實施以農民集體為主體的自主經營，依法運用自產自銷模式，可以有效促進農民穩定收入增加，加強農業合作社發展，促進農民向商品經濟轉型，更好地發揮農民合作組織的政策優惠職能，拓寬增加農民收入的良好途徑。 拓展知識：農業專業合作社是一種以農民為主體的集體經濟組織形式，專業合作社實行“自產自銷”模式，這種模式的作用在于便于提高農業的生產經營效益、減少農業從業人員的從業成本、拓寬農民收入增加的途徑等。