根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例》，“第十條下列項(xiàng)目的進(jìn)項(xiàng)稅額不得從銷項(xiàng)稅額中抵扣：

（二）非正常損失的購進(jìn)貨物，以及相關(guān)的勞務(wù)和交通運(yùn)輸服務(wù)；

（三）非正常損失的在產(chǎn)品、產(chǎn)成品所耗用的購進(jìn)貨物(不包括固定資產(chǎn))、勞務(wù)和交通運(yùn)輸服務(wù)。”

根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》，“第二十四條條例第十條第（二）項(xiàng)所稱非正常損失，是指因管理不善造成被盜、丟失、霉?fàn)€變質(zhì)的損失。”

因此，納稅人存貨盤虧需分析具體原因，屬于規(guī)定的非常損失，其進(jìn)項(xiàng)稅額不得從銷項(xiàng)稅額中抵扣，對應(yīng)的進(jìn)項(xiàng)稅額需做轉(zhuǎn)出處理。

一般納稅人應(yīng)在《增值稅納稅申報表（一般納稅人適用）》附表二16欄“非正常損失”中填列需轉(zhuǎn)出的進(jìn)項(xiàng)稅額。

根據(jù)國家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布《企業(yè)資產(chǎn)損失所得稅稅前扣除管理辦法》的公告（國家稅務(wù)總局公告2011年第25號），只有企業(yè)“會計(jì)上已作損失處理”的，才能在當(dāng)年度申報稅前扣除。稅前扣除損失金額的計(jì)算根據(jù)《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)資產(chǎn)損失稅前扣除政策的通知》（財稅〔2009〕57號）第七條規(guī)定，對企業(yè)盤虧的固定資產(chǎn)或存貨，以該固定資產(chǎn)的賬面凈值或存貨的成本減除責(zé)任人賠償后的余額，作為固定資產(chǎn)或存貨盤虧損失在計(jì)算應(yīng)納稅所得額時扣除。第十條規(guī)定，企業(yè)因存貨盤虧、毀損、報廢、被盜等原因不得從增值稅銷項(xiàng)稅額中抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額，可以與存貨損失一起在計(jì)算應(yīng)納稅所得額時扣除。即：

存貨盤虧稅前扣除的損失金額=存貨賬面成本-責(zé)任人賠款-保險賠款+增值稅進(jìn)項(xiàng)轉(zhuǎn)出額

提醒：財稅〔2009〕57號說的“賬面凈值”或“成本”，實(shí)際上是指計(jì)稅基礎(chǔ)，而不是會計(jì)上確認(rèn)的“賬面凈值”或“成本”，需要注意二者之間的稅會差異。

企業(yè)向稅務(wù)機(jī)關(guān)申報扣除資產(chǎn)損失，僅需填報企業(yè)所得稅年度納稅申報表《資產(chǎn)損失稅前扣除及納稅調(diào)整明細(xì)表》。根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于取消20項(xiàng)稅務(wù)證明事項(xiàng)的公告》（國家稅務(wù)總局公告2018年第65號）規(guī)定，不再留存?zhèn)洳閷I(yè)技術(shù)鑒定意見（報告）或法定資質(zhì)中介機(jī)構(gòu)出具的專項(xiàng)報告。改為納稅人留存?zhèn)洳樽孕谐鼍叩挠蟹ǘù砣恕⒅饕?fù)責(zé)人和財務(wù)負(fù)責(zé)人簽章證實(shí)有關(guān)損失的書面申明。

批準(zhǔn)前：計(jì)入待處理財產(chǎn)損溢

批準(zhǔn)后：收回的保險賠償和過失人賠償計(jì)入其他應(yīng)收款。

殘料計(jì)入：原材料。 

扣除賠償和殘料收入后的凈損失：屬于管理不等原因造成的計(jì)入管理費(fèi)用，原因自然災(zāi)害造成的計(jì)入營業(yè)外支出