一般來說，員工意外傷害保險是可以抵扣醫療費用的。比如，在不幸發生意外傷害時，可以利用員工意外傷害保險來抵扣相關醫療費用，以減輕負擔。例如，某公司職員受傷后，該公司可以通過員工意外傷害保險來抵扣部分醫療費用，從而為職員減輕負擔。