繳納稅款滯納金應該計入應交稅款科目下的滯納金項，具體的科目代碼為應交稅款科目的4-22或4-23，以及相應的對應科目下的滯納金項，通常來說，滯納金的核算金額為滯納金總額和應稅總額中間數（滯納金總額與應稅總額之比）乘以應稅總額。