如果第一次使用自然人電子稅務局扣繳端，卻顯示企業不存在，原因可能是因為輸入的納稅人識別號有誤，或沒有更新最新版本的軟件。為了避免此問題，應首先確認本身輸入的納稅人識別號無誤，然后下載最新版本的軟件。這樣可以確保電子稅務局扣繳端正常使用，避免顯示企業不存在的情況。同時，還建議納稅人定期查看官方網站上的更新消息，及時獲取軟件最新版本。 拓展知識：電子稅務局扣繳端可以實現網上辦稅，并可以實現網上支付，網上查詢等功能，可以有效提高企業的申報效率，提高納稅服務質量。同時，它還可以統一監管，有效提高企業的稅收管理水平，以避免重復申報。