實際上，股東股權轉讓低于實繳資金時，需要繳納個人所得稅。流程是，當股份轉讓結束后，賣方應當向稅務機關申報實繳資金減去轉讓股份所得款，實現凈計算所得額，扣繳個人所得稅，交稅后方可辦理股權變更登記。另外，在完成個人所得稅的繳納后，雙方還需要做好合同簽訂，將雙方的權利義務明確確認，以確保收購完成。 拓展知識：股權轉讓所涉及到的個人所得稅不僅僅與股權轉讓款有關，還包括股權轉讓內所獲得的相關稅收優惠，比如投資所得的免稅等。此外，在發生股權轉讓的同時，還需要留意關聯方的影響，確保買賣雙方的法律利益及行為均合法有效。