處理發票有誤差的情況，可以采取的措施有：1. 對差額進行調整。如果款項少，可以將發票憑證保存，以便以后進行調整。如果款項多，則應按照發票關聯的借方科目，記錄一筆貸方的總額，另外再記錄一筆借方的款項，將多出來的款項沖回給供應商。2. 沖回給供應商。如果確實收取到超出應付金額的款項，最好盡快向供應商發出沖回款項的函或電匯憑證，將多收的款項沖回供應商，以示嚴謹。 此外，還可以結合收發票流程，以免發生發票認證問題。另外，在核對發票信息時，應加強對關聯金額和發票號碼的審核，以確保準確性，減少發票認證問題出現的概率。 拓展知識：財務核算中的發票認證，是指企業在記賬憑證登記時，將發票的基本內容核對正確，對賬務記錄的真實性進行認證的一項工作。