那怎么開勞務發票呢

你這要支付成本，那是對方的勞務收入，你的勞務成本。 但這屬于你的項目成本的呀

專戶工資要實名發到工人個人的銀行卡里 ，從項目部專戶直接發出去的話，都沒有經過勞務公司的公賬，怎么取得對方發票？

這并不影響，你這是保證你撥付出去的款項，沒有被挪作他用，是直接你發給農民工了，讓他提供 工資表，這不影響。

在工程建設領域，鼓勵實行分包企業農民工工資委托施工總承包企業直接代發的辦法。分包企業負責為招用的農民工申辦銀行個人工資賬戶并辦理實名制工資支付銀行卡，按月考核農民工工作量并編制工資支付表，經農民工本人簽字確認后，交施工總承包企業委托銀行通過其設立的農民工工資（勞務費）專用賬戶直接將工資劃入農民工個人工資賬戶。

純勞務分包出去，勞務公司委托項目走專戶代發民工工資，代發的人工費不通過勞務公司的公賬對方也能給項目部開具發票，是這個意思對嗎？

是的，就是這個意思，這是為了防止你撥付的款項沒有發工資，保證民工工資發放到位