為全面了解科技創新在推進蘇州經濟結構調整、應對國際金融危機等方面的作用，推進加快蘇州經濟轉型升級和“三區三城”建設步伐，2010年3月份以來，蘇州市審計局對蘇州市區科技研發、自主創新專項資金（簡稱科技專項資金）的投入、管理和使用等情況進行了專項審計調查。

　　調查表明，2009年以來，蘇州市高度重視對科技創新的決策部署，切實服務“擴大內需、支撐行業振興、促進產業結構調整、加快自主創新布局”的需要，僅2009年市區財政就投入科技專項資金23060萬元，新組織科技項目494項，分別比2008年增長26%和29%。科技專項資金的投入助推了蘇州經濟轉型升級上水平，表現如下：

　　產業技術創新步伐加快。調查發現，為調整科技計劃體系，引導科技資源向新興產業集聚，2009年，蘇州市區73%的科技資金用于扶持企業科技研發，立項扶持涉及新能源及節能等新興產業重點技術領域項目179項，科技創新重點實現有效轉移，2010年，市本級財政科技經費的80%以上將用于支持新興產業培育和發展，科技計劃支持新興產業力度明顯加大。

　　企業創新能力不斷提升。審計調查高度關注企業創新能力的培養，調查表明：2009年，蘇州市科技局組織實施112個自主創新重點扶持項目，大力推進原始創新研發，加大自主知識產權核心技術成果的開發。當年申請專利280項，開發新產品71只、新裝置56只、新工藝32項、新增利稅16236萬元、新增出口1194.5萬元。截至目前，蘇州市有國家高新技術企業688家、省創新型企業195家、技術先進型服務企業36家，數量均居全省首位。2010年，對中小企業的支持力度加大，已獲國家中小企業創新基金項目立項83項，獲資助5955萬元，分別占全省總量的18.3%和18.6%。

　　科技金融結合成效顯現。調查結果顯示，科技金融結合成效明顯。根據蘇州市政府《加強科技金融結合，促進高新技術產業發展的若干意見》等制度辦法，2009年以來，蘇州市科技局等相關部門大力探索政府資金與社會資金、直接融資和間接融資相結合的科技金融體系，并設立了首期5000萬元的科技企業信貸風險補償資金，建立了科技金融服務中心，目前已有85家科技型企業獲得貸款，總額達6.25億元。蘇州成為江蘇省乃至全國創業投資最活躍的地區之一。

　　調查也發現了科技項目信息化管理手段有待完善、科技專項資金對老城區建設產業新格局的導向作用有待進一步發揮等情況，對此，審計提出了相應的整改建議，得到蘇州科技部門的高度重視和積極采納，審計建議為蘇州科技發展和經濟轉型升級發揮了重要作用。