《企業所得稅法》第五十條規定：居民企業在中國境內設立不具有法人資格的營業機構的，應當匯總計算并繳納企業所得稅。這與《企業所得稅暫行條例》第二條“實行獨立經濟核算的企業或者組織，為企業所得稅的納稅義務人”存在較大差異，而差異所導致的直接影響就是地區間稅源轉移問題。

　　按照舊法，不具有法人資格的營業機構，如果符合實行獨立經濟核算條件的，在分支機構所在地繳納所得稅。而實行新《企業所得稅法》后，上述機構則要到總機構所在地匯總納稅。這就影響了分支機構所在地的稅收收入。為解決地區間稅源轉移問題，財政部、國家稅務總局、中國人民銀行出臺了《跨省市總分機構企業所得稅分配及預算管理暫行辦法》，國家稅務總局出臺了《跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理暫行辦法》。但是筆者認為，實踐中還有許多細節問題尚未完全解決。

　　一、適用政策的納稅人的認定問題

　　1.總機構小型微利企業的確認問題。

　　《企業所得稅法實施條例》在解釋什么是小型微利企業時，只籠統地將小型微利企業劃分為工業企業和其他企業。實際上，一個企業存在多種經營形式，既包括工業又包括商業、服務業。那么這樣的企業算工業企業，還是其他企業？條例沒有規定如何區別。筆者建議，應依據收入劃分，如果該企業工業收入占總收入50%以上或占各行業首位，則確認該企業為工業企業，否則按其他企業確認。

　　如何保證小型微利企業確認的連續性也存在問題。如：某企業2007年為小型微利企業，2008年是否為小型微利企業？只有2008年所得稅匯算清繳完成后，即2009年6月才能確認，而這時已經過了2009年第一季度的預繳期。對于這個問題該如何解決需要具體考慮。

　　如果總機構被認定為小型微利企業，其所屬分支機構就不執行就地預繳政策。分支機構的主管稅務機關需要總機構的主管稅務機關出具總機構為小型微利企業的確認文書，以此作為分支機構不就地預繳的憑據。這種情況較多，為便于規范管理，筆者建議國家稅務總局統一制定標準文書。

　　2.事業單位適用政策問題。

　　例如，某行業協會是總機構，是事業單位，無應稅收入，下屬分會是分支機構，也是事業單位，有應稅收入。原來分支機構單獨核算、單獨納稅，現在根據總分機構預繳政策，總機構需要匯總核算，但其對分支機構沒有財務上的管理權。事業單位作為所得稅的一種特殊納稅人，與一般企業存在較大差異。筆者認為，對上述無實際財務管理關系的事業單位總分機構，應不視為總分機構，讓每個事業單位都作為獨立法人核算繳納稅款。

　　3.加盟店問題。

　　作為總機構下屬分支機構的加盟店，原來都是單獨核算、單獨納稅。在這種加盟關系的總分機構中，分支機構使用總公司的品牌，交納管理費，實際是獨立經營、自負盈虧，與總公司經營無關。實行新的總分機構預繳政策后，總機構需要匯總核算，但其對分支機構加盟店沒有財務上的管理權，不能統一負責核算分支機構的稅款。分支機構也不愿意總機構統一核算稅款。對于這種情況，筆者認為，總機構的主管稅務機關應出具分支機構未在總機構核算納稅證明。分支機構的主管稅務機關將分支機構作為獨立法人進行管理。

　　4.總機構撤戶問題。

　　過去，認定企業所得稅納稅義務人的標準為是否實行獨立經濟核算，因此作為單獨納稅的分支機構不會因為總機構撤消而影響核算繳納稅款。新的總分機構預繳政策是以總機構為主體核算稅款。如果總機構撤消，分支機構就無法繳納稅款。筆者建議，在這種情況下，由分支機構單獨核算繳納稅款。

　　二、政策具體執行中的問題

　　1.核定征收問題。

　　實際中有這樣一種情況，即企業總機構和分支機構都實行核定征收，但是新的總分機構預繳政策沒有涉及這個問題。

　　因此，會出現下述情況：一是如果總機構為核定征收企業，就不能保證其準確對分支機構進行納稅分配核算。筆者建議在這種情況下，稅務機關應對總機構實行查賬征收。二是在總機構為查賬征收企業，下屬分支機構為核定征收企業的情況下，原來分支機構單獨核算、單獨納稅，現在按總分機構預繳政策規定，分支機構的應納稅額應由總機構核算分配。為此，主管稅務機關應該不再對所屬分支機構實行核定征收。

　　2.分支機構較多的問題。

　　例如，某總機構下屬分支機構眾多，且有少數跨省分支機構。按新的總分機構預繳政策，每個分支機構都要實行就地預繳，企業核算工作量相當大。并且，同一個區域的多個門店都要單獨繳納稅款，對企業來說手續繁瑣、耽誤時間。對此，筆者建議允許企業按照一定的區劃，合并二級分支機構，核算繳納稅款。

　　3.非正常戶問題。

　　在實際中，無論總機構還是分支機構，都存在大量非正常戶。這些非正常戶影響了稅收管理工作的順利開展。其中跨省市的總分機構，在管理上難度更大。筆者建議國家稅務總局建立全國總分機構信息平臺，以便于各地稅務機關查找、溝通信息，加強對總分機構的管理。

　　4.對分支機構的管理問題。

　　由于總分機構預繳政策的核心是總機構核算分配稅款，因此，分支機構主管稅務機關的任務主要是核實分支機構是否按照總機構提供的分配比例繳納稅款，管理工作比較簡單。而總機構主管稅務機關要對跨省市分支機構進行管理，工作難度非常大，成本非常高。可見，總分機構預繳政策只是解決了跨地區間的收入分配問題，沒有解決稅收管理問題。筆者建議，明確分支機構主管稅務機關的管理職權，提高分支機構主管稅務機關的管理地位，配合總機構稅務機關共同做好對總分機構的管理工作。

　　三、落實總分機構預繳政策中的其他問題

　　申報表設計問題和申報問題。在企業所得稅匯總納稅分支機構分配表中，需要填寫的總機構經營收入總額、工資總額和資產總額三項內容，對于分支機構所得稅收入分配沒有實際意義和參考意義，而且會混淆納稅人對分配的理解。筆者建議，應把這三項內容改為年應納稅所得額、從業人員、資產總額等項目。

　　總之，總分機構預繳政策提出的通過稅收征管解決地區間稅源轉移問題的方法，對于調節地區間稅收收入分配有積極的意義。但是針對上述問題，目前尚需制定一系列配套征管措施，并加強地區間稅收管理的協作，才能將總分機構預繳政策落到實處。