個體戶開居間費發票100萬，需先計算增值稅和附加稅，再考慮個人所得稅。具體稅率根據業務性質和地方政策有所不同。建議詳細記錄收入支出，每年匯算清繳時申報。若不確定，最好咨詢專業會計或稅務顧問。