員工發(fā)生工傷，停工留薪期的工資是免稅的。 依據(jù)《關(guān)于工傷職工取得的工傷保險待遇有關(guān)個人所得稅政策的通知》（財稅[2012]40號）第一條規(guī)定，對工傷職工及其近親屬按照《工傷保險條例》（國務(wù)院令第586號）規(guī)定取得的工傷保險待遇，免征個人所得稅。《工傷保險條例》將停工留薪期工資納入工傷保險待遇的范疇，停工留薪期工資不是勞動者基于正常的勞動索取得的勞動報酬，是由勞動者在發(fā)生工傷期間由工傷保險條例以及醫(yī)囑確定的，因此停工留薪期工資屬于工傷保險待遇。根據(jù)上述的規(guī)定，停工留薪期工資無需征繳個人所得稅