那如果A公司知道了我們跟B公司單獨簽了勞務分包協議，他們有權利干涉我們的決定嗎？

這取決于你們與A公司的協議內容。如果協議中有規定所有的勞務班組都必須由A公司統一管理，那么他們可能有權利干涉。但如果協議中沒有這樣的規定，那么他們就沒有這個權利。在這種情況下，建議你們咨詢專業的法律顧問，以確保你們的行為是合法的。