當個稅工資和匯算清繳工資不一致時，應該以匯算清繳工資作為稅前扣除項目（如專項附加扣除等）的基數，如果匯算清繳工資較低，則需要以較低工資來申報繳納個稅；同時，可能需要添加更多的稅前扣除項目，以獲得更多的個稅減免。如果匯算清繳工資較高，則可能需要縮減稅前扣除項目，以避免因過高的扣除產生的超額個稅。另外，個稅工資和匯算清繳工資不一致時，還需要對工資所在單位繳納的社會保險進行處理，確保社會保險繳納正確。