商貿公司食品過期扔掉的賬務處理，應當根據過期食品的金額采取相應的稅收處理。一般情況下，營業收入中含有商品過期扔掉的費用，需要抵扣進項稅收，但是如果開具增值稅專用發票，是不用再抵扣進項稅收的。拓展知識：企業在處理商品過期扔掉的費用時，要正確開具增值稅專用發票，使企業在進行稅收處理時不受影響。