甲公司做會計分錄時，需要做應付賬款轉移的記錄， 借方：應付賬款；貸方： 其他應收款/其他，這樣就可以完成甲公司的會計分錄。 乙公司會計分錄是：借方： 銀行存款；貸方： 其他應收款/其他， 這樣就可以完成乙公司會計分錄。 有關甲公司與乙公司的代付，最好還是簽訂代付協議，以確保雙方權利義務，減少糾紛產生。代付協議應該記錄甲乙雙方的身份信息、代付金額、付款期限、代付流程、提前終止和違約責任等內容，且甲乙雙方均簽字確認此協議，以便對未來的糾紛有一定的法律效應。