如果增值稅普通發票被對方偷偷作廢，而我們又已經入賬了，那么，我們就需要按照相關的稅收規定，正確的處理這個問題。 首先，我們應該及時發現對方偷偷作廢增值稅普通發票，并盡快開具替換發票。另外，在開票過程中，根據《增值稅普通發票管理辦法》；《增值稅普通發票及電子發票申報、驗收、使用指引》等有關規定，完善發票使用流程，做到內部管控，避免出現票損問題。 此外，在發票填開、使用等過程中，最好能夠將發票信息與系統進行全面對接，如實反映發票使用情況，以便核實發票是否真實有效，有效的提高發票的使用效率。 拓展知識： 另外，在使用增值稅發票過程中，要注意遵守增值稅發票的使用規定，及時清理發票的使用信息，準確的辦理發票的開具、使用登記和核銷等步驟，正確的填寫發票內容，加強發票的保管和管理，以免造成違反稅收管理規定的后果。