分公司是否還要匯算清繳，這取決于總公司有沒有把分支機構的稅款匯算一起繳納。如果是，分公司不再需要單獨匯算清繳；如果沒有，則各分支機構仍需要按照規定進行匯算清繳。 總機構從技術上看，是把分支機構的稅款匯算到總公司的稅務機關進行繳納的，從而實現總公司匯算清繳。但實際上，可能由于總公司無法得知每個分支機構的實際稅金收入及出口情況等，總公司只能根據總賬戶上的金額估算出要匯算清繳的稅款，而不能確切地知道每個分支機構的實際稅金金額。這就需要分支機構根據實際的稅金的收入、出口及稅金減免等情況，按照各自的稅務機關的規定，進行匯算清繳。 拓展知識： 匯算清繳的目的在于實現稅收的均衡征繳，避免出現總公司“轉移鎖定”分支機構的稅收回報等問題。同時，匯算清繳還有利于改善稅務管理，簡化企業稅收審計，降低企業稅收管理成本，提高稅收管理效率。