總分機構匯總匯算清繳是按照總分公司備案時間來做匯總匯算清繳的，如果沒有備案是不能做匯總匯算清繳的。為了能夠做到匯總匯算清繳，申請者應該事先對總分機構進行備案，在備案成功后就可以擁有匯總匯算清繳的能力了。 匯總匯算清繳一般允許企業的所得稅由有納稅能力的企業自行繳納，也可以由總分機構代繳，可以節省納稅人的工作量。匯總匯算清繳也可以減輕企業和政府之間的納稅責任。因此，匯總匯算清繳對于企業來說是有很大好處的。 此外，如果沒有備案，企業也可以嘗試通過網上申報納稅的方式來實現稅務管理，但要求的準確率會相對較低，而且也不能享受匯總匯算清繳的便利。因此，企業應該盡量在擁有備案后才進行匯總匯算清繳。