先給出答案：公司應按照員工實際發放的工資提成，但是，應該在提成中扣除每月因公司代繳的社保部分。 由于提成算法是按照銷售額來計算的，因此，公司應按照員工實際發放的工資進行提成，而不是按應發工資進行提成。例如，如果員工本月應發1000元，但實際發放了500元，那么公司應該按照500元進行提成，而不是按1000元進行提成。 另外，公司應在計算提成時，扣除每月因公司代繳的社保部分。這是因為，公司的社保代繳是以扣除員工工資的形式完成的，而提成計算是以員工實際收入為基礎來進行定義的，因此，應該把代繳的社保部分從提成中扣除。 總的來說，公司應按照員工實際發放的工資提成，但是，應該在提成中扣除每月因公司代繳的社保部分。 拓展知識：計算提成時，除了考慮工資發放和社保代繳雙方的情況外，公司還應考慮員工實際獲得的其他收入，如補貼、福利等，對這部分收入進行適當的減免或者扣除，以避免公司支付更高的提成費用。