原因有以下幾點： 1. 申報企業所得稅匯算清繳時彌補虧損是針對抵減稅款的，只能在當期使用，而年度申報表中的虧損卻可以結轉到以后年度使用； 2. 企業所得稅匯算清繳根據當期實際所得額來計算納稅，而年度申報表要以當期核定損益之和為基礎進行稅款計算，所以可能出現稅款不一致的情況。 3. 當企業被打上了“黑名單”，導致未能按規定的截止期匯繳企業所得稅時，會有追回滯納金，以及重新計算稅款，也會出現補稅的情況。 拓展知識： 企業在繳納企業所得稅的過程中，還要用到企業實施檢查、報告缺陷稅收處理情況等。這就要求企業不僅要做好按期繳稅、按期報稅的準備，還需要把握實際繳納稅款和申報稅款之間的差異，才能更好地控制企業所得稅風險。