對于自然人申報的工資和實發的工資不一致的情況，應該及時處理。一般的解決方法是，當事人要承擔應繳納稅款的義務，首先進行雙方協商確認，協助當事人填寫報稅申報表，稅務機關將會根據實際情況處理欠稅程序，當事人根據處理結果完成應繳稅款及相關費用，最后向稅務機關提供核實后的賬務資料，申請完成稅務補繳手續。拓展知識:當自然人申報的工資和實發的工資不一致，應及時雙方協商確認，確保納稅義務得到履行，以減少納稅義務的不合理支出。