在建工程領用公司原材料不做進項稅額轉出，是因為在建工程作為建筑業，屬于投資性款項，不作商品交易，原材料也屬于投入品；而在建工程作為增值稅的應稅項目，是指在建工程結束時，納稅人售出或者發票開具企業經營房地產，應納增值稅。在建工程的過程中，涉及到的費用都屬于投資性款項，不涉及稅負，以后涉及到的稅負主要產生在施工完成、發票開具時，納稅人應納增值稅，以及交付使用售出房地產后，對收入產生的銷項稅。