機關事業單位工會單獨立賬的提取工會經費的應發數是不應該從任何員工的工資中做扣款的。根據《勞動合同法》，就業者的工資不得減少，組織單位歸口管理的經費來源應是勞動者工資以外的。依據《工會法》第三十七條，勞動者不得按照工會經費來源規定，從勞動合同所約定的勞動報酬中扣除相應的費用。因此，提取工會經費的應發數應不扣除任何員工的工資。 拓展知識：按照相關法律法規的規定，勞動者的工資在支付過程中不得減少，如果單位在為勞動者發放工資時作出任何形式的扣款，在法律上均不具有效力。單位應將工資發放和工資管理做到合法合規，以保護勞動者的合法權益。