確實，抵扣聯發票應該單獨裝訂成冊，備查。這是因為，抵扣聯發票是企業銷項發票，主要用于證明企業進行了銷售活動，以及由此產生的應稅收入和應納稅款額，是企業自身必備的記帳憑證，是企業稅務自查，和政府稅務檢查的重要依據。 另外，由于抵扣聯發票是企業自身的財務憑證，和記賬聯發票內容不一樣，應該單獨裝訂，另行備查，以備檢查。此外，如果企業與稅務機關的稅收計算有爭議，企業需要憑借抵扣聯發票來證明自己的交易情況及稅收事實，以便向稅務機關進行正當的申辯。因此，抵扣聯發票必須單獨裝訂成冊，備查，以便隨時使用。