煤炭企業是可以留底退稅的，但是具體退稅情況取決于該企業的稅務環境。根據《增值稅管理辦法》的規定，除去規定有免稅的項目外，增值稅應該由企業上繳，企業可向稅務部門申請留底退稅，如果稅務部門認可，企業每個月就可以獲得留底退稅，比如上月上繳500,000增值稅，可以向稅務部門申請留底退稅，但該企業還需提供相關發票，以及稅務部門的認可，才能得到退稅。 此外，有些企業由于納稅義務較低，可以通過稅務部門的認可獲取免稅資格，可以減輕稅收負擔，避免留底退稅麻煩。在這種情況下，企業可以根據稅收情況，申請免稅資格，以減少稅負。