不可以。貨代運費的發票上的金額一般都是按照貨代費用確認單上確認的金額進行開票的。如果發票上的金額少于貨代費用確認單上確認的金額，則存在可能有外部費用未在發票上開票，比如倉儲費、倉單費等，這樣的情況有可能會給企業的開票及相關的報表帶來問題，所以最好的方式就是由貨代將費用全部合理開票，以避免發票費用不確定帶來的問題。 拓展知識：貨代運費開票，多數公司要求貨代按約定的價格對貨物進行運輸，運費相關的發票屬于購銷合同范疇，所以要求發票的金額應該與貨代費用確認單的金額一致，不得出現發票金額少于貨代費用確認單上的金額。