排污權證辦理費用可以納入企業財務核算的費用科目。一般會納入污染防治設施投資費、環境保護費用或環保費用等科目中。 如果企業按照政府新版環保征稅政策發生費用，可以納入當年應納稅款及應付賬款中。排污許可費、排污備案費、污水處理費、污染治理費、排放標準外污染治理費等可以全部納入稅前扣除項目之一的污染防治費用核定范圍內。 拓展知識：排污許可證的辦理有嚴格的規定，一般企業申報需要準備的資料包括：營業執照、組織機構代碼證、稅務登記證（名稱）、法人代表證明、廠區用地使用許可證以及排污設施投資及建設審批文件等。此外，排污許可證辦理還需要進行實地查驗，核實排污設施的實際情況，以及環境排放標準等。