有關單位與員工協議以及按靈活用工繳納社保違法與否一般會受到法律法規的制約，如果這種協議和繳納社保的方式與有關的法律法規不符，就應該認為是違法的。例如，國家規定，企業應當按正式用工形式繳納社會保險，不得采取按靈活用工形式繳納社會保險，而且不能拒絕依法繳納社會保險費；而且要根據征繳時間、費率規定繳納社會保險，不得擅自調整繳費標準；另外還有一些法律法規要求企業按照正式用工形式在一定范圍內招聘員工，不得采取靈活用工形式招聘。所以，協議與繳納社保的方式是否違法，要看其與有關法律法規是否一致，對于違反法律法規的行為，一般會受到法律的制約。 拓展知識：靈活用工是指當前市場上企業按服務期限、勞動量等特征采取靈活的形式簽訂勞動合同，指定勞動者在協議規定的時間內按照協議的條款完成勞動任務的勞動關系。靈活用工的好處是可以更好地滿足居民對就業的需求，但是也會存在一些問題，比如單位可能利用靈活用工的形式來逃避依法繳納社會保險費的義務，這就會影響勞動者的權益。