第二季度城鎮土地使用稅已申報扣款未入賬，首先需要檢查是否已經正確提交申報資料；如果資料正確提交但是還是未入賬，可能需要確認是否已經正確到帳，即查詢稅款銀行的到賬情況；如果銀行方面也沒有成功入賬，可以考慮聯系當地稅務局進行咨詢，了解進一步的扣款情況；此外也可以拉取上季度和本季度的申報對比，以及納稅情況，確認是否出現了新的申報情況，以確保最終申報的精確性及完整性。拓展知識：城鎮土地使用稅是指在城鎮及其他成熟地區使用土地和建筑物時，依法向財政部門繳納的稅收。城鎮土地使用稅是按照土地使用權的實際價值，根據國家和地方稅法、委托法規定的稅額稅率，計稅征收的稅收。