老師您好，申請獨立核算和仍存稅收往來之間并無必然聯系。根據《中華人民共和國企業所得稅法》的規定，獨立核算是企業根據自身管理需要，依據預算、決算和財務報表的原則對企業的資產、負債、收入、支出等進行單獨核算的機制，它完全是企業內部行為，而稅務往來則是企業間的行為。當公司存在子公司時，兩者之間就會產生稅務往來，如子公司撥款給總公司、總公司轉讓資產給子公司等，此時，總公司和子公司之間會有稅務往來，影響子公司的所得稅。而相對獨立核算，只要企業內部有單獨的識別手段，就可以根據財務數據進行獨立核算，不會受到稅務往來的影響。 拓展知識：獨立核算的實施可以使企業的內部控制有效，尤其是大型企業。只有獨立核算才能更好地控制資金流動，避免資金濫用、虛報開支等問題，更好地進行財務報表匯總和盈利分配。同時，它也可以幫助企業了解自身發展情況，合理安排未來發展戰略，幫助管理層更好地進行管理和決策。