是的。轉賬或其他付款超過1000萬元的，都可能被稅務機關嚴格稽查，以檢查該款項是否合法，是否有稅收規避的情況發生。對于分公司剛剛成立的情況，總公司轉往來款達到上千萬，尤其需要引起注意。 企業應該及時準備相關財務及稅務文件，證明款項的來源，避免被稅務機關稽查甚至立案查處。此外，應明確用途，按規定做好發票章程，及時核實稅務申報，保證財務的合法性和準確性，并以此為依據進行費用核算，以確保稅收的合法性和安全性。 此外，總公司給分公司轉賬也需要注意資金使用，防止出現流失財產的情況，同時也要保證資金安全，避免被非法侵吞或被騙影響企業發展，投資者的利益受損。