處理退稅申報發生異常的方法如下： 1、確認準確信息：首先，企業應在開具發票時確認發票信息是否準確，核實準確后，就可以正常申報退稅，若發現出現異常，需及時作出處理。 2、修改發票：若發現發票出現異常情況，可申請發票改正，若改正的發票可在已經發放的偏遠地區電子發票查驗系統上查驗，才能有效。 3、申請再開票：若無法通過發票改正，就需要申請重新開票，根據國家開發票的有關形式，可重新開具發票并申請退稅。 4、免稅處理：對于確認發票信息異常無法修正的情況，可依據國家規定申請免稅處理，但這種方式可能會降低企業的退稅金額。 拓展知識： 關于退稅申報，企業可以通過傳統的電子稅務局、稅務事務所等方式進行申報；也可以通過新興的大數據技術、云計算技術，使用在線稅務平臺完成退稅申報，無須擔心出現異常情況的發生。