主要有五點不同。 1、計稅方法不同 一般納稅人原則上采用一般計稅方法（提供公共交通運輸服務等特定應稅行為的一般納稅人也可選擇簡易計稅方法）。 小規模納稅人采用簡易計稅方法。 2、稅率與征收率不同 一般納稅人適用增值稅稅率（簡易計稅的除外），目前增值稅稅率包括13%、9%、6%，0。 小規模納稅人適用增值稅征收率，目前增值稅征收率包括5%、3%。 3、納稅申報期不同 一般納稅人繳納增值稅，原則上實行以月為納稅期申報納稅。 小規模納稅人繳納增值稅，原則上實行以季度為納稅期申報納稅。 4、增值稅發票使用不同 一般納稅人可以開具和取得增值稅專用發票。除部分特定行業的小規模納稅人可以選擇自行開具專用發票外，大部分小規模納稅人不能自開專用發票，如果需要開具專用發票可以到稅務機關申請代開。 5、抵扣進項稅額的區別 一般納稅人： 購進貨物、勞務、服務、無形資產和不動產支付或者負擔的增值稅額可以作為當期進項稅額按規定進行抵扣; 應納稅額=當期銷項稅額－當期進項稅額。 小規模納稅人： 購進貨物、勞務、服務、無形資產和不動產，即使取得了增值稅專用發票也不能抵扣; 應納稅額=銷售額×征收率。