國外的A總公司付款給我們國家的公司采購貨物，然后我們國內有A國內分公司，我公司已經給境外公司開了形式發票，但是A總公司還需要我們給境內A分公司開專用發票，合同里面也沒約定，這個可開可不開嗎？

我們只能開給總公司發票，不能開給分公司發票對嗎？我們收到總公司款，應該是開給總公司，而不能開給分公司對吧

是的，你的理解很對。按業務性質，應該給總公司開票