已經從一個股東賬戶全部投進去了，怎么辦呢

你好 最好是有一個代出資的協議 或者你原路退回 然后讓兩個人私下轉款 ，讓實際的股東在轉款入公戶賬戶做比較好

代出資合法嗎？有私人協議，對外這塊需不需要證明這筆錢是借款或者是證明這錢就是另外2個股東的？

你好 這個不太合理的， 最好是個人股東賬戶轉款來做賬合理。