登錄電子稅務局（申報端），選擇“企稅年報”。 在填報列表中必須勾選《A107010免稅、減計收入及加計扣除優惠明細表》和《A107012研發費用加計扣除優惠明細表》。 打開《A107012研發費用加計扣除優惠明細表》，根據研發費用會計賬和輔助賬，如實填入各項數據。 系統自動計算表中“本年研發費用加計扣除總額”（行次51），點擊“保存”。 打開《A107010免稅、減計收入及加計扣除優惠明細表》，確保加計扣除總額已經自動計入表中“三、加計扣除”（行次25），點擊“保存”。 最后，打開匯算清繳主表，確保加計扣除額已經自動計入表中“減：免稅、減計收入及加計扣除（填寫A107010）”（行次17），點擊“保存”并提交申報。