農業專業合作社收到的政府補助是否需要交所得稅，要視情況而定。 如果合作社能夠提供規定資金專項用途的資金撥付文件，財政部門或其他撥付資金的政府部門對該資金有專門的資金管理辦法，且合作社對該資金以及以該資金發生的支出單獨進行核算，那么這部分政府補助可作為不征稅收入，不需要繳納企業所得稅。但不征稅收入用于支出所形成的費用，不得在計算應納稅所得額時扣除；用于支出所形成的資產，其計算的折舊、攤銷不得在計算應納稅所得額時扣除。 如果不符合上述不征稅收入條件，或者合作社選擇不將補貼作為不征稅收入處理，那么補貼收入通常需要計入應稅所得，繳納企業所得稅。