在工程結算中，工程進度款和竣工結算款都是重要的支付方式。以下是處理這兩種款項的步驟：
1. 工程進度款
工程進度款是指在工程進展的過程中，按照合同約定支付的款項。通常，工程進度款的支付是分期進行的，每個階段的支付比例也是合同中規定的。
在處理工程進度款時，需要注意以下幾點：
- 確認合同約定的支付比例和時間節點。
- 根據合同約定的支付比例和時間節點，編制工程進度款的支付計劃。
- 確認工程進度款的支付依據，包括工程量清單、施工進度報告等。
- 在支付工程進度款時，需要核對支付金額和支付時間是否符合合同約定。
2. 竣工結算款

竣工結算款是指工程完工后，根據合同約定進行的最后一次結算款項。通常，竣工結算款的支付是在工程完工后進行的，支付金額包括工程量清單中未結算的部分和變更額等。

在處理竣工結算款時，需要注意以下幾點：

- 確認合同約定的結算方式和時間節點。
- 根據合同約定的結算方式和時間節點，編制竣工結算款的支付計劃。
- 確認竣工結算款的支付依據，包括工程量清單、變更單等。
- 在支付竣工結算款時，需要核對支付金額和支付時間是否符合合同約定。

總之，在處理工程進度款和竣工結算款時，需要嚴格按照合同約定進行，并注意核對支付金額和支付時間是否符合合同規定。