《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）附件1《營業稅改征增值稅試點實施辦法》后附《銷售服務、無形資產、不動產注釋》第二條規定，銷售無形資產，是指轉讓無形資產所有權或者使用權的業務活動。無形資產，是指不具實物形態，但能帶來經濟利益的資產，包括技術、商標、著作權、商譽、自然資源使用權和其他權益性無形資產。技術，包括專利技術和非專利技術。

財稅〔2016〕36號文件附件3《營業稅改征增值稅試點過渡政策的規定》第一條第（二十六）項規定，納稅人提供技術轉讓、技術開發和與之相關的技術咨詢、技術服務免征增值稅。技術轉讓、技術開發，是指《銷售服務、無形資產、不動產注釋》中“轉讓技術”、“研發服務”范圍內的業務活動。試點納稅人申請免征增值稅時，須持技術轉讓、開發的書面合同，到納稅人所在地省級科技主管部門進行認定，并持有關的書面合同和科技主管部門審核意見證明文件報主管稅務機關備查。

《科學技術部關于印發<技術合同認定規則>的通知》（國科發政字[2001]253號）第六條規定，以技術入股方式訂立的合同，可按技術轉讓合同認定登記。

根據上述規定，公司以專利技術投資入股按轉讓無形資產繳納增值稅，符合條件的可以享受免征增值稅優惠。

以專利技術投資入股如果符合條件免征增值稅，不需要繳納城建稅及附加，如果不符合免征增值稅的條件，繳納增值稅的同時還需要繳納城建稅及附加。

《財政部 稅務總局關于進一步實施小微企業“六稅兩費”減免政策的公告》（財政部 稅務總局公告2022年第 10 號 ）規定，省、自治區、直轄市人民政府根據本地區實際情況，以及宏觀調控需要確定，對增值稅小規模納稅人、小型微利企業和個體工商戶可以在50%的稅額幅度內減征資源稅、城市維護建設稅、房產稅、城鎮土地使用稅、印花稅（不含證券交易印花稅）、耕地占用稅和教育費附加、地方教育附加。 

根據上述規定，公司以專利技術投資入股如需繳納增值稅，符合上述2022年第 10 號 公告規定的城建稅及附加可以享受減征50%優惠。

企業以專利技術投資入股，按財產轉讓所得繳納企業所得稅，可以享受相關的稅收優惠。

（一）減免稅優惠

《企業所得稅法》（主席令第六十三號，主席令第二十三號修改）第二十七條第（四）項規定，符合條件的技術轉讓所得，可以免征、減征企業所得稅。
《企業所得稅法實施條例》（國務院令第512號）第九十條規定，企業所得稅法第二十七條第（四）項所稱符合條件的技術轉讓所得免征、減征企業所得稅，是指一個納稅年度內，居民企業技術轉讓所得不超過500萬元的部分，免征企業所得稅；超過500萬元的部分，減半征收企業所得稅。
《財政部 國家稅務總局關于居民企業技術轉讓有關企業所得稅政策問題的通知》（財稅[2010]111號）第一條規定，技術轉讓的范圍，包括居民企業轉讓專利技術、計算機軟件著作權、集成電路布圖設計權、植物新品種、生物醫藥新品種，以及財政部和國家稅務總局確定的其他技術。其中：專利技術，是指法律授予獨占權的發明、實用新型和非簡單改變產品圖案的外觀設計。
根據上述規定，公司以專利技術投資入股，符合條件的可享受不超過500萬元的部分免征企業所得稅，超過500萬元的部分減半征收企業所得稅的優惠政策。

（二）分期繳納

《財政部 國家稅務總局關于非貨幣性資產投資企業所得稅政策問題的通知》（財稅[2014]116號）第一條規定，居民企業（以下簡稱企業）以非貨幣性資產對外投資確認的非貨幣性資產轉讓所得，可在不超過5年期限內，分期均勻計入相應年度的應納稅所得額，按規定計算繳納企業所得稅。
根據上述規定，公司以專利技術投資入股，所得可以在不超過5年期限內分期均勻計入相應年度的應納稅所得額計算繳納企業所得稅。

（三）遞延納稅

《財政部 國家稅務總局關于完善股權激勵和技術入股有關所得稅政策的通知》（財稅[2016]101號）第三條規定，企業或個人以技術成果投資入股到境內居民企業，被投資企業支付的對價全部為股票（權）的，企業或個人可選擇繼續按現行有關稅收政策執行，也可選擇適用遞延納稅優惠政策。選擇技術成果投資入股遞延納稅政策的，經向主管稅務機關備案，投資入股當期可暫不納稅，允許遞延至轉讓股權時，按股權轉讓收入減去技術成果原值和合理稅費后的差額計算繳納所得稅。技術成果是指專利技術（含國防專利）、計算機軟件著作權、集成電路布圖設計專有權、植物新品種權、生物醫藥新品種，以及科技部、財政部、國家稅務總局確定的其他技術成果。
《國家稅務總局關于股權激勵和技術入股所得稅征管問題的公告》（國家稅務總局公告2016年第62號）第二條規定，選擇適用《通知》中遞延納稅政策的，應當為實行查賬征收的居民企業以技術成果所有權投資。 企業適用遞延納稅政策的，應在投資完成后首次預繳申報時，將相關內容填入《技術成果投資入股企業所得稅遞延納稅備案表》。
根據上述規定，公司以專利技術投資入股可以選擇遞延納稅政策，經向主管稅務機關備案，投資入股當期可暫不納稅，允許遞延至轉讓股權時，按股權轉讓收入減去技術成果原值和合理稅費后的差額計算繳納企業所得稅。
思考：減免稅優惠與分期繳納和遞延納稅政策能否疊加享受呢？
目前對于減免優惠與分期繳納政策沒有明確是否可以疊加享受，個人認為，可以疊加享受；根據財稅[2016]101號第三條規定，個人認為減免稅優惠與遞延納稅政策不能疊加享受。實務中需要與主管稅務機關溝通具體的執行口徑。

《印花稅法》（主席令第八十九號）附件《印花稅稅目稅率表》中產權轉移書據包括專利權轉讓書據，按價款的萬分之三稅率計算繳納印花稅。如投資公司為小規模納稅人或小型微利企業可享受減征50%優惠。
需要說明的是，被投資單位除按“產權轉移書據”繳納印花稅外，還需要根據《印花稅法》的規定對營業賬簿按萬分之二點五繳納印花稅，如被投資單位為小規模納稅人或小型微利企業可享受減征50%優惠。