鄉鎮衛生院是實行新型農村合作醫療的基礎，也是加強基層醫療衛生機構建設的重點。根據江蘇省《關于深化醫藥衛生體制改革的實施意見》和《基層醫療衛生服務體系建設與發展規劃》要求，每個建制鄉鎮必須設立一所政府舉辦的衛生院。針對目前不少鄉鎮衛生院已經改制，股權為個人所有的現狀，采取政府對鎮級衛生院進行股權回購是較為可行的方法，而資產清理又是確保股權回購順利完成的一個關鍵環節。為此建議：（一）以賬面資產真實性審計為基礎，確認現有資產價值。鎮級衛生院是事業性質單位，從本質上講，醫院所構建的固定資產和添置的醫療設備，不是完全以營利為目的。因此，在鎮級衛生院資產清理審計中，對所有資產不做重新評估。但對賬面資產的真實性和完整性，要做好全面清理和核實工作。（二）以收支結余真實性審計為重點，正確維護三者利益。重點審計核實收入、支出和結余的真實、準確和合規性；核實結余分配的準確、合理合法性；核實專用資金、基金使用合規性，是否做到專款專用。通過科學、合理、準確界定鎮級衛生院的各年度實際結余，正確維護國家、股東和職工三方面利益。（三）明確資產清理審計依據，確保審計中運用尺度一致。財政和衛生主管部門應明確鎮級衛生院資產清理審計的依據，并做好對參審計人員的培訓和輔導，使得審計人員在清理過程中做到標準統一，尺度一致，保證審計結果客觀公正，公平合理。