高等學校的財務管理體制，確定學校同國家財政的預算撥款、繳款關系，它在很大程度上決定著高等學校同其他各方面的財務關系。

　　內容 高等學校實行“統一領導、集中管理”的財務管理體制；規模較大的學校實行“統一領導、分級管理”的財務管理體制。

　　措施 高等學校財務工作實行校（院）長負責制。符事條件的高等學校，設置總會計師，協助校（院）長全面領導學校的財務工作。凡設置總會計師的高等學校，不設與總會計師職權重疊的副校（院）長代行總會計師職權。高等學校必須單獨設置財務處（室），作為學校的一級財務機構，在校（院）長和總會計師的領導下，統一管理學校的各項財務工作，不得在財務處（室）之外設置同級財務機構。高等學校內后勤、科技開發、校辦產業及基本建設等部門因工作需要設置的財務機構，只能作為學校的二級財務機構，其財會業務接受財務處（室）的統一領導。高等學校二級財務機構必須遵守和執行學校統一的財務規章制度，接接受財務處（室）的監督和檢查。

　　人員配置 高等學校內設置財務機構，必須相應配置專職財會人員。校內各級財會主管人員的任免應當經過上一級財務主管部門同意，不得任意調動或者撤換。財會任意的調入、調出、專業技術職務的評聘須由財務部門會同有關部門辦理。