土地增值稅是采用超率累進稅率計算的。只有先計算出增值率，即增值額占扣除項目的比例后，才能確定適用稅率，并計算應納稅額。其計算公式如下：

　　增值率＝增值額／扣除項目金額×100％

　　應納稅額＝∑（每級距的土地增值額×適用稅率）

　　這種計算方法比較繁瑣，要分段計算，匯總合計。因此，在實際工作中，一般采用速算扣除法計算，其計算公式如下：

　　應納稅額＝土地增值額×適用稅率－扣除項目金額×速算扣除率

　　[例1]某房地產開發公司轉讓一塊已開發的土地使用權，取得轉讓收入1400萬元，為取得土地使用權所支付金額320萬元，開發土地成本65萬元，開發土地的費用21萬元，應納有關稅費77.7萬元。計算應納土地增值稅如下：

　　開發費用21萬元，未超過（320＋65）×10％＝38.5萬元，可據實扣除。

　　扣除項目金額＝（320＋65）×（1＋20％）＋21＋77.7＝560.7（萬元）

　　增值額＝1400－560.7＝839.3（萬元）

　　增值額占扣除項目比例＝839.3÷560.7＝149.69％

　　應納稅額＝839.3×50％－560.7×15％＝335.54（萬元）

　　[例2]某房地產開發公司轉讓高級公寓一棟，獲得貨幣收入7500萬元，獲得購買方原準備蓋樓的鋼材2100噸（每噸2500元）。公司為取得土地使用權支付1450萬元，開發土地、建房及配套設施等支出2110萬元，支付開發費用480萬元（其中：利息支出295萬元，未超過承認標準），支付轉讓房地產有關的稅金47萬元。計算應納稅額如下：

　　收入額＝7500＋2100×0.25＝8025（萬元）

　　扣除項目金額＝（1450＋2110）×（1＋20％）＋295＋178＋47＝4792（萬元）

　　其他開發費用實際支出比例＝（480－295）／（1450＋2110）＝185／3560＝5.2％

　　超過5％的限額，按5％計算如下：

　　（1450＋2110）×5％＝178（萬元）

　　增值額＝8025－4792＝3233（萬元）

　　適用級次＝3233÷4792＝67.5（％）

　　應納稅額＝3233×40％－4792×5％＝1053.6（萬元）