免稅所得是指企業(yè)根據(jù)《企業(yè)所得稅法》規(guī)定的稅收優(yōu)惠政策可以免征所得稅的所得額一般情況下，免稅所得應(yīng)免征所得稅，但在企業(yè)有虧損需要彌補的情況下，免稅所得是否參與虧損的彌補，如果參與，應(yīng)如何彌補呢？

　　企業(yè)免稅所得稅彌補虧損問題，國家稅務(wù)總局《關(guān)于企業(yè)的免稅所得彌補虧損問題的通知》（[1999]34號）文件中明確規(guī)定：

　　1、按照稅收法規(guī)的規(guī)定，企業(yè)的某些項目免征所得稅。如果一個企業(yè)既有應(yīng)稅項目，又有免稅項目，其應(yīng)稅項目發(fā)生虧損時，按照稅收法規(guī)規(guī)定可以結(jié)轉(zhuǎn)以后年度彌補的虧損，應(yīng)該是沖抵免稅項目所得后的余額。此外，雖然應(yīng)稅項目有所得，但不足彌補以前年度虧損的，免稅項目的所得也應(yīng)用于彌補以前年度虧損。

　　2、享受減免稅政策的納稅人，其一個納稅年度的虧損額是指按照本《通知》規(guī)定，當(dāng)年應(yīng)享受減免稅政策的項目與非享受減免稅政策的項目盈虧相抵后的余額。

　　3、如果納稅人在納稅年度內(nèi)享受減免稅政策，當(dāng)年有盈利，而以前年度發(fā)生虧損，又在彌補期內(nèi)，納稅人應(yīng)先用本年非享受減免稅政策的所得來彌補其以前年度虧損，不足彌補的，再用應(yīng)享受減免稅的所得來彌補。

　　就是說雖然應(yīng)稅項目有所得額，但不足彌補以前年度虧損的，免稅項目的所得也應(yīng)用于彌補以前年度虧損。“因此，免稅所得在彌補虧損問題上，應(yīng)該是先彌補虧損，彌補虧損后如有剩余，剩余部分再免征所得稅。具體有以下幾種處理方法：

　　一、在某一年度，企業(yè)既有應(yīng)稅項目，又有免稅項目，但應(yīng)稅項目發(fā)生虧損時，免稅所得彌補虧損的處理方法。

　　例1：A企業(yè)2002年通過會計核算確定應(yīng)稅項目全年虧損10萬元，另有《企業(yè)所得稅法》規(guī)定的免稅所得額2萬元。按照企業(yè)免稅所得彌補虧損的規(guī)定，A企業(yè)2002年結(jié)轉(zhuǎn)以后年度彌補的虧損額應(yīng)為8萬元（即10萬元－2萬元）而不是10萬元。也就是說，A企業(yè)2002年應(yīng)先用免稅所得2萬元彌補當(dāng)年應(yīng)稅項目的虧損后，才能將余額結(jié)轉(zhuǎn)以后年度并用以后年度的所得彌補，而不是先將免稅所得免稅，然后再將應(yīng)稅項目虧損結(jié)轉(zhuǎn)以后年度彌補。

　　二、在某一年度，企業(yè)既有應(yīng)稅項目，又有免稅項目，而且應(yīng)稅項目有所得額時，免稅所得彌補虧損的處理方法。

　　例2：A企業(yè)2001年通過會計核算確定全年虧損10萬元，并依法結(jié)轉(zhuǎn)以后年度進行彌補。

　　情況一：2002年會計核算確定全年利潤9萬元，其中免稅所得2萬元；

　　情況二：2002年會計核算確定全年利潤11萬元，其中免稅所得2萬元；

　　情況三：2002年會計核算確定全年利潤13萬元，其中免稅所得2萬元。

　　根據(jù)上述資料，2002年應(yīng)彌補2001年虧損數(shù)的利潤如下：

　　情況一：首先用2002年應(yīng)稅項目利潤7萬元（即9萬元－2萬元）先彌補2001年虧損；彌補后剩余的未彌補的虧損3萬元，再用免稅所得2萬元彌補；未彌補完的2001年的虧損部分1萬元可以留待以后年度彌補。

　　情況二：首先用2002年應(yīng)稅項目利潤9萬元（即11萬元－2萬元）先彌補2001年的虧損；彌補后剩余的未彌補的虧損1萬元，再用免稅所得1萬元彌補；免稅所得剩余的1萬元，再免征所得稅。留待以后年彌補的虧損數(shù)為0.

　　情況三：首先用2002年應(yīng)稅項目利潤11萬元（即13萬元－2萬元）中的10萬元先彌補2001年的虧損；彌補2001年虧損后剩余的應(yīng)稅項目利潤1萬元，再根據(jù)稅法規(guī)定交納企業(yè)所得稅；而免稅所得2萬元免征所得稅。所以，該企業(yè)2002年應(yīng)交所得稅＝10000元×33％＝3300元。

　　總之，通過上述分析舉例可以看出，企業(yè)在有應(yīng)稅項目虧損的情況下，免稅所得彌補虧損的正確做法是先彌補應(yīng)稅項目虧損后，才能免征所得稅，而不是先免征所得稅，后彌補應(yīng)稅項目的虧損。