為規范研發機構采購國產設備退稅管理，國家稅務總局于日前制定了《研發機構采購國產設備退稅管理辦法》（國家稅務總局公告2011年第73號），自2011年1月1日至2015年12月31日施行。

　　辦法要求，享受采購國產設備退稅的研發機構，應在申請辦理退稅前持規定資料向主管退稅稅務機關申請辦理采購國產設備的退稅認定手續：企業法人營業執照副本及組織機構代碼證（原件及復印件）；稅務登記證副本（原件及復印件）；退稅賬戶證明；稅務機關要求提供的其他資料。辦法下發前已辦理出口退稅認定手續的，不再辦理采購國產設備的退稅認定手續。

　　研發機構發生解散、破產、撤銷以及其他依法應終止采購國產設備退稅事項的，應持相關證件、資料向其主管退稅稅務機關辦理注銷認定手續。已辦理采購國產設備退稅認定的研發機構，其認定內容發生變化的，須自有關管理機關批準變更之日起30日內，持相關證件、資料向其主管退稅稅務機關辦理變更認定手續。

　　研發機構應自購買國產設備取得的增值稅專用發票開具之日起180日內，向其主管退稅稅務機關報送《研發機構采購國產設備退稅申報審核審批表》申請退稅，逾期不得申報。申請退稅時，附送：采購國產設備合同；增值稅專用發票（抵扣聯）；付款憑證；稅務機關要求提供的其他資料。屬于增值稅一般納稅人的研發機構購進國產設備取得的增值稅專用發票，應在規定的認證期限內辦理認證手續。未認證或認證未通過的不得申報退稅。

　　對屬于增值稅一般納稅人的研發機構的退稅申請，主管退稅稅務機關必須在增值稅專用發票稽核信息核對無誤的情況下，辦理退稅。對屬于非增值稅一般納稅人研發機構的退稅申請，主管退稅稅務機關必須發函調查，在確認增值稅專用發票真實、發票所列設備已按規定申報納稅后，方可辦理退稅。

　　采購國產設備的應退稅額，按增值稅專用發票上注明的稅額確定。凡企業未全額支付所購設備貨款的，按已付款比例和增值稅專用發票上注明的稅額確定應退稅款；未付款部分的相應稅款，待企業實際支付貨款后再予退稅。

　　研發機構采購國產設備取得的增值稅專用發票已申報抵扣的，不得申報退稅。已申報退稅的增值稅專用發票，研發機構不得再申報進項稅額抵扣。

　　研發機構已退稅的國產設備，由主管退稅稅務機關進行監管，監管期為5年。監管期的起始時間以增值稅專用發票開具日期為準。監管期內發生設備所有權轉移行為或移作他用等行為的，研發機構必須按以下計算公式，向主管退稅稅務機關補繳已退稅款。

　　應補稅款＝增值稅專用發票上注明的金額×（設備折余價值÷設備原值）×適用增值稅稅率

　　設備折余價值＝設備原值－累計已提折舊

　　設備原值和已提折舊按所得稅法規定的辦法計算。

　　研發機構以假冒采購國產設備退稅資格、既申報抵扣又申報退稅、虛構采購國產設備業務、提供虛假退稅申報資料等手段騙取國產設備退稅款的，按照有關法律、法規處理。

　　辦法明確，對該辦法下發前，研發機構已取得的增值稅專用發票，準予在2012年4月30日前申報退稅，主管退稅稅務機關按辦法規定，辦理退稅；研發機構已取得的納入增值稅防偽稅控系統的增值稅普通發票，準予在2012年4月30日前申報退稅，主管退稅稅務機關在函調確認增值稅普通發票真實、發票所列設備已按規定申報納稅后，辦理退稅。對按商資發[2010]93號文件規定已認定的外資研發中心，其采購的國產設備適用該辦法，不需重新認定。