排污許可證的持有者需要申報環境稅。 根據《中華人民共和國環境保護稅法》的規定，直接向環境排放應稅污染物的企業事業單位和其他生產經營者為環境保護稅的納稅人，應當依照本法規定繳納環境保護稅。這里的應稅污染物包括大氣污染物、水污染物、固體廢物和噪聲等。因此，持有排污許可證的企業，作為直接向環境排放應稅污染物的主體，無疑需要繳納環保稅。