這種情況可能涉及到發票和賬戶的對應問題。首先，確保A公司開具的發票正確無誤。然后，與B公司溝通，確認款項支付情況及雙方財務流程。如果B公司已收到款項，A公司應向B公司提供相應發票，確保財務記錄一致。關鍵在于保持良好的內部溝通和遵循財務規定。如有需要，可咨詢專業會計師獲取具體操作建議。