但是應交稅費-增值稅科目，貸方有銷項稅額，借方是又有應交稅費-進項稅額轉出科目，這樣做分錄本期一借一貸，增值稅這樣算下來還有留抵，和本期交增值稅金額不一致呢

確實，當進項稅額轉出時，應調整應交增值稅賬戶。具體操作如下： 借：應交稅費-增值稅-進項稅額轉出 貸：應交稅費-增值稅-銷項稅額 這樣處理后，再按實際銷售情況調整銷項稅額，確保增值稅計算準確無誤。